Pada 1977 Ndaw menjadi sebahagian daripada Tentera Udara Mali.[2] Pada satu ketika, Ndaw berperanan sebagai pembantu kepada Presiden Mali Moussa Traoré.[3] Beliau mengundurkan diri dari jawatan ini pada 1990 sebagai protes campur tangan isteri Traoré dengan urusan pemerintahan.[1] Di bawah Presiden Alpha Oumar Konaré, Ndaw bertugas sebagai timbalan ketua kakitangan Tentera Udara Mali antara tahun 1992 dan 2002.[1] Pada 1994, beliau lulus dari École de guerre di Paris, Perancis.[2] Pada 2003 Ndaw menjadi ketua kakitangan Tentera Udara Mali.[1] Sepanjang kerjayanya, beliau juga berkhidmat sebagai timbalan ketua kakitangan Pengawal Kebangsaan Mali.[2] Dari tahun 2008 sehingga bersara pada 2012, di kemudian hari beliau menjadi ketua Biro urusan veteran dan mangsa perang.[4] Ndaw bersara dengan pangkat Kolonel Mejar.[5]

Pada 28 Mei 2014 Ndaw menggantikan Soumeylou Boubèye Maïga sebagai Menteri Pertahanan di bawah Presiden Ibrahim Boubacar Keïta.[5][6][7] Semasa dalam jawatan beliau menandatangani perjanjian pertahanan dengan Perancis. Beliau juga mengusahakan penyusunan semula Angkatan Tentera Mali.[5]

Pada 21 September 2020 setelah rampasan kuasa beberapa minggu sebelumnya, Ndaw dilantik sebagai presiden oleh sekumpulan 17 pemilih.[8] Assimi Goïta dilantik sebagai naib presiden. Pemerintahan sementara mereka dijadualkan untuk memimpin dalam tempoh 18 bulan setelah rampasan kuasa 2020 di Mali.[3] Jurucakap pemimpin politik-agama Mahmoud Dicko memuji pencalonannya sebagai presiden.[3] Pemimpin M5-RFP yang aktif sejak protes Mali 2020, juga memberi isyarat sokongan.[6] Ndaw dirasmikan sebagai presiden pada 25 September.[9]

Setelah menjawat jawatan secara rasmi Ndaw menyatakan bahawa beliau akan memerangi rasuah, penipuan pilihan raya dan menghormati perjanjian antarabangsa yang telah dibuat sebelumnya.[9] Dia juga menunjukkan bahawa dia akan terus memerangi pasukan pengganas dan mencegah penyalahgunaan orang awam oleh angkatan bersenjata Malian.[10][11] Berikutan pelantikan Ndaw, Jean-Claude Brou, Presiden Suruhanjaya Komuniti Ekonomi Negara-Negara Afrika Barat (ECOWAS) menyatakan bahawa ECOWAS hanya akan menarik balik sekatan terhadap Mali sekiranya seorang Perdana Menteri awam dilantik oleh Ndaw.[9][11] Pada 28 September Ndaw menamakan Moctar Ouane sebagai Perdana Menteri.[12]